APS therapie is één van de meest veilige manieren van behandelen. Desondanks zijn er toch een aantal situaties waarbij APS therapie niet mag worden toegepast:

• Personen met elektrische implantaten (pacemaker, enz)
• Personen die lijden aan epilepsie
• Personen die lijden aan kanker
• Kinderen beneden de leeftijd waarop zij kunnen aangeven wat zij voelen
• Personen die zwanger zijn
• Personen met recentelijk hersen- of hartinfarct of acute trombose (minder dan 3 maanden)

APS therapie kan veilig gebruikt worden bij knie- en/of heupprothesen of andere prothesen of metalen implantaten.